Постановлением Совета Министров Республики Беларусь от 20 мая 1991 г. № 191 был создан Белорусский научно-исследовательский центр «Экология» (Бел НИЦ «Экология»). В 1999 г. Центр преобразован в Учреждение «Белорусский научно-исследовательский центр «Экология» (Учреждение Бел НИЦ «Экология»). С 10 марта 2005 г. появилось современное название «Республиканское научно-исследовательское унитарное предприятие «Бел НИЦ «Экология» (РУП «Бел НИЦ «Экология»).
Центру определялся широкий круг деятельности:
ведение Национальной системы мониторинга окружающей среды (НСМОС) Республики Беларусь;
проведение научных исследований по оценке экономических и социальных последствий вредного воздействия на окружающую среду;
разработка комплексных территориальных схем охраны окружающей среды и природопользования областей, районов и отдельных городов;
распространение правовой информации в области охраны окружающей среды и природопользования;